AIOB nasce il 31 Dicembre 1999 con lo scopo di riunire sotto un unico tetto obiettivi di rispetto biologico nella pratica clinica odontoiatrica e di stimolare la ricerca e lo scambio tecnico-scientifico e culturale nel mondo dell’ Odontoiatria, affermandone la dignità e la novità del suo ruolo nell’ambito della Medicina Integrata.

Proprio questi obiettivi portarono l’ Accademia ad impegnarsi nella valutazione clinica e scientificamente critica dei materiali di utilizzo odontoiatrico. In particolar modo AIOB ha contribuito ad evidenziare la tossicità dell’amalgama, lega a base di mercurio utilizzata nelle otturazioni, sottolineandone, fra l’altro, l’importanza di una corretta rimozione: manovra la più delicata per il rilascio dei vapori di mercurio e, potenzialmente la più iatrogena, per l’alterazione degli equilibri enzimatici e dell’omeostasi dell’organismo.

Nel 2003 AIOB organizza  il primo congresso internazionale di Odontoiatria Biologica, dal titolo:
“I nuovi paradigmi dell’ Odontoiatria metal-free: metalli pesanti endorali ed immunocompatibilità”, in occasione del quale vengono sottolineati la validità dell’ approccio olistico nella Medicina Odontoiatrica, il ruolo dei metalli pesanti di utilizzo clinico e la loro immunogenicità. Gli effetti e la risonanza di quell’evento, rinforzato negli anni seguenti dalla presenza in due sessioni del Collegio dei Docenti,  sono ancor oggi evidenti.